Asili ya Maabara: Kesi ni Imara Hata Sasa

Hapo awali nilitoa kesi kwamba jumla ya hali karibu asili ya SARS-CoV-2 inatosha kwa sababu inayowezekana ya kuamini kuwa virusi vilitoka kwenye maabara. Mbali na hali zinazozunguka asili ya SARS-CoV-2, ushahidi tunakosa kwa asili ya zoonotic inafanya kesi yetu kuwa na nguvu zaidi.

Nje ya lenzi finyu ya vyombo vya habari vya kawaida ambavyo haviwezi kuangazia kesi hii muhimu ya kiuchunguzi duniani, siri kubwa zaidi ya mauaji ya kisayansi katika karne hii inatatuliwa.

Ushahidi mpya umeibuka ili kuimarisha kesi ya asili ya maabara. Karatasi zenye dosari zinazodai asili ya zoonotic zimefichuliwa kuwa zenye dosari zaidi - wakati sisi wataalam wa mada huru tuliweza kuliona hili tangu mwanzo, sasa linakuwa dhahiri zaidi hata kwa umma. Zaidi ya hayo, nadharia ya asili ya maabara imefanya ubashiri wa ajabu kuhusu yaliyomo katika rasimu za hivi majuzi za FOIA'd za ruzuku ya DEFUSE.

Kesi ya asili ya maabara sasa iko wazi vya kutosha kwamba sio tu kwamba tunaweza kuona asili ya maabara bila shaka yoyote, lakini tunaanza kukusanya ushahidi unaoendana na ufichaji, kwamba ajali hii inayohusiana na utafiti ilijulikana kwa watu ambao walijua. walifadhili kazi hiyo, ni nani alijua kuwa waliifanya kazi hiyo ndogo, na ni nani alijua walifanya kazi hiyo.

Hebu turudie kile tulichojua tayari, ni nini kipya, na kile tunachoweza kukisia kwa njia inayofaa kuhusu nani alijua nini na lini.

Kuanguka kwa Karatasi za Asili ya Zoonotic

SARS-CoV-2 ni sarbecovirus ya popo ambayo iliibuka Wuhan mbali na maeneo yenye virusi vya sarbecovirus ya wanyamapori, katika jiji lisilo na popo, kwenye mlango wa Taasisi ya Wuhan ya Virology, hazina kubwa zaidi ya sarbecoviruses za popo ulimwenguni.

Mlipuko huo ulianza wakati fulani mnamo Oktoba-Novemba 2019, kabla ya kuzuka kwa Soko la Chakula cha Baharini la Huanan. Wakati Worobey et al. walidai kesi za "mapema" zilijikita kwenye soko la mvua, walishindwa kujibu kesi za mapema kabla ya kuzuka kwa soko la mvua, agizo la serikali ya China kuharibu kesi za mapema au itifaki ya uhakiki ambayo ilihitaji muunganisho wa soko la mvua, na utafiti wa data ya mitandao ya kijamii ilionyesha kuongezeka kwa haraka kwa masharti ya kutafuta huduma haikuwa karibu na Soko la Chakula cha Baharini la Huanan, lakini kuvuka mto katika hospitali zilizo karibu na Taasisi ya Wuhan ya Virology.

Mpya: Michael Weissman, mwanafizikia mkali kiasi ambaye amekuwa akikadiria uwezekano wa nadharia za asili ya maabara dhidi ya zoonotic, alitoa uchunguzi rahisi unaoonyesha uchanganuzi wa Worobey et al. unakanusha mawazo na hitimisho zao wenyewe. Worobey et al. ripoti kwamba umbali wa wastani kwa soko la mvua kutoka kwa kesi "zisizounganishwa" ulikuwa chini kuliko umbali wa wastani kwa soko la mvua kutoka kwa kesi zilizounganishwa na soko la mvua. Hiki ni kielelezo muhimu cha kitakwimu cha upendeleo wa sampuli - ikiwa hapakuwa na upendeleo wa sampuli, hakuna uthibitishaji wa upendeleo wa kesi kulingana na ukaribu wa soko la mvua, basi umbali huu unapaswa kuwa sawa, au kesi zisizounganishwa labda zaidi.

Worobey et al. ilifanya hitimisho kulingana na dhana kwamba kesi ambazo hazijaunganishwa zilithibitishwa kwa bahati nasibu, lakini uchambuzi wao wenyewe unakanusha dhana hiyo na kwa hivyo kufichua kile tulichosema wakati wote: kesi hizi za mapema ni maoni ya upendeleo wa milipuko ya mapema iliyotolewa na serikali ya China. Kesi zilizotangulia soko la mvua, kuongezeka kwa masharti ya kutafuta utunzaji karibu na Taasisi ya Wuhan ya Virology, na upendeleo uliothibitishwa wa kitakwimu wa hifadhidata ya soko la mvua yote lakini inakanusha nadharia ya soko lenye unyevu, na kutuacha bila ushahidi wowote unaounga mkono maelezo ya asili kwa nini popo sarbecovirus ilitokea katika jiji lisilo na popo, lakini kwa maabara maalumu kwa sarbecoviruses za popo.

Pekar na wengine. pia walijaribu kudai mti wa mageuzi wa mapema wa SARS-CoV-2 hauwezekani sana kutokea kwa bahati chini ya utangulizi mmoja, na walikadiria Factor ya Bayes ya 60 kwa matawi mawili makubwa kwenye msingi wa SARS-CoV-2 phylogeny. (yaani walikadiria mti wa mageuzi tunaoona una uwezekano mara 60 chini ya asili ya zoonotic kuliko asili ya maabara).

Wenzangu na mimi tulionyesha karatasi hii haikuhalalisha hitimisho lake kwa njia nyingi: (I) mtindo wao wa mageuzi haukuwa sahihi (walitumia kielelezo cha mageuzi ya VVU badala ya kuenea kwa SARS-CoV) na mtindo huu ulifanya matawi makubwa kuwa na uwezekano mdogo (II) mfano wao wa uthibitisho wa kesi, kama Worobey et. al (iliyoandikwa na kundi lile lile), haikuwa sahihi na uthibitishaji wa kesi ulioegemea upande wowote kupitia mawasiliano au ufuatiliaji wa eneo ungefanya matawi mawili makubwa zaidi, na (III) kuna mlolongo wa SARS-CoV-2 ambao unakidhi vigezo vya ujumuishaji vya waandishi. lakini ambayo yalitengwa bila sababu, na mfuatano huu unapendekeza hakuna matawi mawili makubwa lakini badala yake nasaba za kati, na kudhoofisha kabisa msingi wa majaribio wa Pekar et al.

New: Bango lisilojulikana kwenye X (zamani liitwalo Twitter) lilichunguza msimbo huko Pekar et al. na nikakuta walikuwa na hitilafu kwenye nambari zao. Waandishi wanashindwa kukadiria uwezekano wa matawi mawili-makubwa chini ya hali mbadala na kwa hivyo Makadirio ya Mambo ya Bayes sio Mambo ya Bayes. Mdudu huyu kwenye msimbo, peke yake, anaangusha sio-a-Bayes-Factor yao ya 60 hadi Bayes Factor ya 3, ambayo iko ndani ya eneo la kelele, na hiyo haitoi hesabu ya upendeleo wa ziada, ukosefu wa usahihi wa mfano, na changamoto za takwimu kwa wenzako. na nikatambua.

Matokeo ya mwisho ni kwamba mti wa mageuzi wa SARS-CoV-2 hautoi ushahidi wowote wa matukio mengi ya spillover. Matokeo haya ya mwisho ni ushahidi muhimu unaopendelea asili ya maabara. Tumeona spillover moja ya SARS-CoV mnamo 2002 wakati milipuko ya biashara ya wanyama ilisababisha maambukizo ya washughulikiaji wa civet katika kiwango kikubwa cha kijiografia cha Mkoa wa Guangdong. Virusi zinazozunguka kwenye civets zilikuwa tofauti za kijeni na kwa hivyo mti wa mageuzi wa virusi vinavyoambukiza washughulikiaji wa civet ulikuwa na matawi mengi, moja kwa kila tukio la spillover, na matawi hayo yalitofautiana kwa zaidi ya mabadiliko 2 tu ambayo yalitenganisha matawi mawili makubwa kwenye msingi wa SARS. -CoV-2 mti wa mabadiliko (ambayo inaweza kutokea katika tukio moja la maambukizi ya binadamu na binadamu).

Mtandao wa biashara ya wanyama ndio njia kuu ambayo virusi vya sarbecovirus na jamaa wa karibu katika Mkoa wa Yunnan wa mbali wanaweza kufika Wuhan, lakini milipuko ya biashara ya wanyama huacha alama za miguu. Wanyama wanawekwa pamoja na wanawasiliana kwa karibu na watunza wanyama kwa maili nyingi na katika miji mingi. Kama milipuko mingine kwenye mitandao ya usambazaji wa chakula (fikiria: salmonella kwenye lettuce), mlipuko wa SARS-CoV-1 uliambukiza watu katika mtandao mzima wa usambazaji wa chakula au wanyama. Washughulikiaji wa Civet waliugua katika matukio tofauti tofauti katika Mkoa wote wa Guangdong. SARS-CoV-2, kwa upande mwingine, haikuacha alama kati ya Yunnan na Wuhan, serikali ya Uchina ilifunga Wuhan tu bado hakukuwa na milipuko iliyoripotiwa nje ya Wuhan au mkoa wa Hubei.

Serikali ya Uchina iliweka vipimo vya PCR kwa wasafiri wanaotoka Wuhan, na kuzingatia upimaji kwenye eneo nyembamba ni sera ya ajabu ya afya ya umma kwa nchi yoyote inayojaribu kudhibiti milipuko ya biashara ya wanyama na mfano mpana wa kijiografia. Sera nyingine ya ajabu ya afya ya umma ilikuwa CCP kuamuru uharibifu wa kesi za mapema. Iwapo kulikuwa na mkurupuko wa biashara ya wanyama, basi tunapaswa kujaribu kwa upana mtandao mzima na kuogopa matukio ya ziada ya kuenea katika maeneo tofauti ya kijiografia kupata wanyama (km mbwa wa raccoon) kutoka kwa mtandao sawa wa biashara.

Katika mlipuko mpana kama huu wa kijiografia katika mtandao wa biashara wenye uwezekano wa kutokea mara kwa mara, visa vya awali ni vya thamani zaidi kwa maelezo yaliyomo kuhusu sababu ya spillover, wanyama walioambukizwa, mistari maalum ya mitandao ya biashara ya wanyama kufuatilia, na jinsi tunaweza kuweka chupa uvujaji kutoka kwa wanyama hadi kwa watu.

Kesi ya Kuimarisha Asili ya Maabara

Makosa haya yote ya kuibuka kwa SARS-CoV-2, mageuzi ya SARS-CoV-2, na sera ya milipuko ya CCP, hata hivyo, inaeleweka kabisa ikiwa uvujaji haukuwa kutoka kwa wanyama kwenda kwa watu, lakini kutoka kwa hazina kubwa zaidi ya ulimwengu ya sarbecoviruses za popo. mji huo huo, umbali wa kutembea kutoka kwa soko lenye majimaji na hospitali zilizo katikati ya shughuli za awali za kutafuta huduma.

Nadharia ya asili ya maabara inachunguza uwezekano kwamba SARS-CoV-2 inaweza kuwa imevuja kutoka kwa maabara, na kuelewa kikamilifu nadharia ya asili ya maabara lazima kuchunguza utafiti unaofanywa na maabara. Ni hivyo tu hutokea kwamba kuna maabara ya sarbecovirus ya popo katika jiji moja ambapo sarbecovirus hii ya popo iliibuka; umaalum wa uhusiano kati ya virusi vilivyotokea na maabara ni kubwa sana ni kama kupata simbamarara akizunguka-zunguka jiji kwa umbali wa kutembea kutoka kwa hifadhi kubwa ya paka huko Ujerumani, kwa hivyo kujua kuna mchoro wa patakatifu wa paka wakubwa kutoka ulimwenguni kote. muktadha muhimu kwa paka mkubwa anayezurura mitaani karibu.

Taasisi ya Wuhan ya Virology ilikuwa taasisi inayoongoza kwa kusoma coronavirus ya wanyamapori. Watafiti hawa wangekamata aina zote za wanyama na hata sampuli za mitandao ya biashara ya wanyama kutafuta virusi vipya. Wangerudisha sampuli hizi za virusi vya wanyamapori hadi Wuhan kwa utafiti zaidi, na kwa kushirikiana na EcoHealth Alliance wangeagiza sampuli za virusi vya wanyamapori zilizopatikana na vyama vya nje, vya Amerika.

Kazi ya virusi vya wanyamapori huko Wuhan ni muktadha muhimu, lakini jambo muhimu zaidi kujua juu ya nadharia ya asili ya maabara ni ruzuku iliyoandikwa mnamo 2018 - pendekezo la KUFUTA. Pendekezo la DEFUSE lilitolewa kutoka kwa mikono isiyo na nia ya EcoHealth Alliance na DRASTIC, kikundi cha wahuni wanaochunguza nadharia ya asili ya maabara tangu 2020.

DEFUSE iliwasilishwa kwa simu ya DARPA PREEMPT. Kwa bahati mbaya, nina ufahamu wa ndani wa simu hii kwa sababu nilisaidia kuandika ruzuku iliyofaulu ya DARPA PREEMPT, nilikuwa nikifanya kazi kwenye timu ya DARPA PREEMPT kwa miaka 2 kabla ya Covid (na DARPA YFA kuhusu virusi vya popo tangu 2017), na nilihudhuria. mkutano wa DC ambapo tulipata kusikia kutoka kwa timu zingine za DARPA PREEMPT. Kwa hivyo, ninaweza kusoma DEFUSE na kuiweka katika muktadha wa simu ya ruzuku na kazi zingine za kisasa kwenye uwanja, na ninaweza kutambua kwa haraka sifa bainifu za DEFUSE kufichua malengo ya kipekee ya utafiti na nia ya waandishi ambayo ni tofauti na kazi pana ya virusi vya wanyamapori. .

Simu ya DARPA PREEMPT ililenga kuzuia kumwagika kwa pathojeni. Wito huo ulitafuta mapendekezo ya kubaini "aina zenye uwezo wa kuruka," neno jipya ambalo lilirejelea aina za vimelea vilivyo na uwezo ulioongezeka wa kuruka kizuizi cha spishi, haswa zile zilizo na uwezo ulioongezeka wa maambukizi ya kuendelea kwa wanadamu ambayo yanaweza kusababisha janga. Kisha, ili kuzuia kuenea, mwito huo ulitafuta mapendekezo yanayolenga kuzuia wanyamapori kwa namna fulani kupata aina hizi zenye uwezo wa kuruka na/au afua ambazo zilipunguza hatari ya wanadamu kuingiliana na wanyamapori wakati na mahali walipokuwa na aina hizi zenye uwezo wa kuruka.

Ili kukupa mfano wa ruzuku ya DARPA PREEMPT, acha nishiriki kidogo kuhusu ruzuku niliyokuwa nayo. Nilikuwa sehemu ya timu inayosoma virusi vya henipavirus za popo kama vile Hendra, Nipah, Cedar n.k. Tulipendekeza kuwa na timu kubwa ya kimataifa ya kukamata popo kote Afrika, Kusini-mashariki mwa Asia, na Australia, sampuli za popo kwa virusi vya henipa, na kubainisha ni lini na wapi tutawapata popo walioambukizwa. pamoja na utofauti wa maumbile ya virusi vya henipavirusi zao.

Kizuizi muhimu zaidi cha kuingia kwa virusi vingi vya wanyamapori ni hatua katika mzunguko wa maisha ya virusi inayoitwa "kufunga vipokezi," au kushikamana na vipokezi vya wapangishaji wapya, kwa hivyo tungezingatia masomo yetu ya quasispecies phenotypes kwa kuwa na maabara kutengeneza kipokezi- kumfunga protini za henipaviruses kwenye maabara (sio virusi vyote) na kupima uwezo wao wa kuunganisha vipokezi vya binadamu. Kwa seti ndogo ya spishi zinazoweza kuruka, tungejaribu kukuza virusi katika maabara ya BSL-4 (kiwango cha juu zaidi cha usalama wa viumbe hai), na tungeunda chanjo dhidi ya aina hizi za quasis zilizotambuliwa kutoka porini.

DEFUSE ilipendekeza kuchukua sampuli ya virusi vya sarbeco katika SE Asia, lakini hawakupendekeza kuchunguza tofauti zilizopo za sarbecoviruses katika asili, badala yake walikuwa wakitafuta kipengele maalum cha jeni ambacho hakijawahi kuonekana hapo awali katika sarbecoviruses: tovuti ya furin cleavage ( FCS). Hili pekee, si la kawaida sana - kwa nini waweke dau la ruzuku ya dola milioni 15 kwa kutafuta kipengele ambacho hakijawahi kuzingatiwa katika maumbile hapo awali?

Maeneo ya Furin cleavage yalikuwa yamerekodiwa katika virusi vya corona vilivyo mbali sana kama vile MERS-CoV, alphacoronaviruses za paka, au baadhi ya virusi vya corona vya binadamu, na kote kote ilitambuliwa kuwa FCS huongeza uwezo wa virusi kufunga vipokezi na kuingia kwenye seli. anuwai pana ya vipokezi jeshi na seli. DEFUSE mapendekezo ya kutafuta maeneo ya furin cleavage na if walipata moja, ingiza FCS ndani ya aina nyingi zaidi ili kupima upitishaji wao. Upimaji wa virusi na kufanya kazi na panya wa kibinadamu (kwa mfano kupima uambukizaji wa virusi na FCS) haungefanyika huko Buenos Aires, sio Atlanta, sio Cape Town au Sydney, hata Beijing…ingetokea Wuhan. Hatimaye, watafiti hawa wangeunda chanjo dhidi ya sarbecovirus kama hiyo na kuwachanja popo ili kuzuia kumwagika.

Hongera kwa mtazamo wa ruzuku katika kuunganisha vipokezi na kuingiza kisanduku, lakini utambulisho wao wa motifu ambayo haijawahi kuonekana hapo awali si ya kawaida sana. Hakuna timu nyingine yoyote ya PREEMPT iliyopendekeza kufanya mambo yasipatikane katika asili. Pendekezo la kutafuta kitu ambacho hakijawahi kuandikwa na ibadilishe karibu na virusi vingine katika matukio ya upatanishi ya kudhaniwa sio uelekeo unaotiririka katika virusi vya wanyamapori. Wataalamu wa virusi vya wanyamapori huangalia kile tunachopata katika wanyamapori, na kujifunza kile tunachopata katika wanyamapori; hatutumii mawazo yetu kufanya uvumbuzi usio wa asili wa chimeric ambao haupatikani katika wanyamapori na kisha kuhusisha mambo haya ya kutisha.

SARS-CoV-2 iliibuka Wuhan na tovuti ya kugawanyika kwa furin ambayo haijawahi kuonekana kwenye sarbecovirus. Inapaswa kusisitizwa kuwa, kwa ufahamu wetu wa kimataifa, "sarbecovirus na tovuti ya furin cleavage" haikuwepo katika asili kabla ya 2020, lakini ilikuwepo katika pendekezo la ruzuku la kufanya kitu. isiyozidi kupatikana katika maumbile, na kwamba riwaya ya kibaolojia ilipendekezwa kufanywa huko Wuhan. Tovuti halisi ya upasuaji wa furin inayopatikana katika SARS-CoV-2 inapatikana katika protini nyingine, protini inayoitwa alpha-ENaC kupatikana kwa binadamu na alisoma sana katika chuo kikuu sawa (UNC) kama moja ya PI ya DEFUSE.

New: Rasimu za ruzuku ya DEFUSE iliyopatikana hivi karibuni na Emily Kopp katika Haki ya Kujua ya Marekani ilipata vipande kadhaa vya ushahidi unaoimarisha uhusiano kati ya DEFUSE na tovuti ya upasuaji wa furin inayopatikana katika SARS-CoV-2. Kwanza, kiongozi wa DEFUSE, Rais wa EcoHealth Alliance Peter Daszak, alitaja katika maoni kwamba, wakati wangependekeza kufanya kazi zao hatari katika maabara ya BSL-3 ya UNC, baada ya kukubali ruzuku wangeweza kupakua kazi hiyo kwa maabara za BSL-2 huko Wuhan.

Maoni haya ni sawa na njama ya kuhadaa na kulaghai DoD ya Marekani katika ruzuku yao na kupunguza pembe katika usalama wa viumbe ili kupunguza gharama, kufanya kazi hatari zaidi si Buenos Aires au Raleigh au Amsterdam, lakini huko Wuhan. Pili, rasimu zina mtaji mahususi zaidi wa "furin cleavage" kuliko ruzuku ya mwisho - dau la mwisho la ruzuku kwa kusisitiza maeneo ya "proteolytic" cleavage, lakini rasimu huweka kwenye furin, na kuongeza umaalum wa uhusiano kati ya DEFUSE na SARS-CoV. -2. Hatimaye, na muhimu zaidi, waandishi wanapendekeza eneo maalum katika genome ambapo wataingiza tovuti hizi za kufuta furin: mpaka wa S1/S2, dirisha nyembamba katika jeni la nucleotide 3,600, na SARS-CoV-2 ina tovuti yake ya kufuta furin. katika hasa eneo lililopendekezwa katika ruzuku hizi.

Tovuti ya upasuaji wa furin pekee inapaswa kutosha kwa sababu inayowezekana ikizingatiwa kukosekana kwa kielelezo cha kipengele hiki mnamo 2018 wakati DEFUSE iliandikwa na umaalumu wa uwekaji wao uliopendekezwa unaolingana haswa unaoonekana katika SARS-CoV-2. Daszak anaonyesha ufahamu wa kanuni na nia za usalama wa viumbe hai za mashirika ya serikali ya Marekani, na alifanya njama ya kupuuza sheria na kanuni hizi ili kupunguza gharama mara tu alipopokea ufadhili wa walipa kodi wa Marekani kwa kazi yake.

Hata hivyo, kuna zaidi.

Ili kuingiza tovuti ya furin cleavage katika SARS-CoV-2, watafiti wangehitaji kuwa na nakala ya DNA ya virusi vya RNA. Ili kutengeneza nakala ya DNA ya virusi vya RNA, wangeunda “mfumo wa kubadili chembe cha urithi.” Hata toleo lililowasilishwa la DEFUSE linataja kuwa watatumia teknolojia ya reverse genetics kuokoa virusi kutoka kwa mfuatano wa jenomu kwenye kompyuta, kubadilishana jeni za spike, na kuingiza tovuti za furin cleavage ndani ya clones hizi za DNA ili kutengeneza virusi vilivyobadilishwa. Viongozi wawili kati ya watatu katika uwanja wa mifumo ya kijenetiki inayorudi nyuma ya coronavirus walikuwa kwenye ruzuku ya DEFUSE: Ralph Baric na mwanafunzi wake wa zamani, Shi Zhengli wa Taasisi ya Wuhan ya Virology.

Mnamo 2022, Valentin Bruttel na Tony Van Dongen waligundua muundo usio wa kawaida katika genome ya SARS-CoV-2. Mikasi miwili maarufu ya uhandisi wa kibaiolojia inayotumiwa kutengeneza mifumo ya nyuma ya jenetiki - BsaI na BsmBI - inaonekana kugawanya jenomu ya SARS-CoV-2 katika sehemu 6, na hii inaweza kutengeneza mfumo mzuri wa nyuma wa jeni. SARS-CoV-2 inaonekana kwa mhandisi wa kibaiolojia kama virusi vya IKEA, kana kwamba kuna mtu tayari ameweka wakati ili kuhakikisha kuwa inaweza kuunganishwa kwa urahisi na zana zinazopatikana kwa urahisi.

Tulikadiria uwezekano wa muundo huu kuonekana katika asili na tukaandika hati ya karatasi alama za vidole za endonuclease kwenye jenomu la SARS-CoV-2. Sio tu kwamba mpangilio wa anga wa tovuti hizi za kukata/kubandika sio za kawaida sana, lakini mabadiliko yanayozisogeza ni uundaji wa mabadiliko ya kibiolojia yaliyotumiwa katika kazi ya awali, na mkusanyiko wa mabadiliko haya "kimya" ni mara 8-9 zaidi kati ya haya yaliyohamishwa. -kuzunguka maeneo ya kuunganisha ikilinganishwa na sehemu nyingine za jenomu. Uchambuzi huu ulituongoza kwenye nadharia yetu ya asili ya sanisi ya SARS-CoV-2 na mkusanyiko wa sehemu 6, kwa kutumia vimeng'enya vya BsaI na BsmBI. Virusi vya IKEA vinaweza kuagizwa katika sehemu 6 na kutumia tu screwdriver ya BsaI na wrench ya allen ya BsmBI, unaweza kuweka sehemu pamoja kwa urahisi.

New: Rasimu zile zile za DEFUSE zilizotajwa hapo juu zinazoelezea uwekaji wa FCS katika mpaka wa S1/S2 pia zina maelezo zaidi kuhusu mbinu zinazopendekezwa za kuokoa na kurekebisha virusi mwitu kutoka kwa sampuli za popo. Hasa, baada ya EcoHealth kusafirisha sampuli za popo hadi Wuhan, walipendekeza kupanga sampuli na kuokoa virusi vya sarbecovirus kwa kutumia mifumo ya kijeni ya kinyume iliyokusanywa na "sehemu 6" na katika muktadha huu ni pamoja na makadirio ya gharama ya kimeng'enya cha BsmBI.

Maelezo sahihi ya kimbinu yaliyomo katika rasimu za DEFUSE ni maelezo haswa yaliyotabiriwa na nadharia kwamba SARS-CoV-2 ilitoka kama bidhaa ya utafiti ya kazi kama DEFUSE.

Kazi kama ya DEFUSE imekuwa nadharia kuu ya asili ya maabara, na inapotosha watu kusema kwamba nadharia za asili ya maabara zingeanzia katika jiji lolote lenye maabara kwa sababu kulikuwa na jiji moja tu lililokuwa na maabara ambayo ilipendekeza utafiti huu mahususi - hii. haikupendekezwa kufanyika Lima au Mexico City au Alberta au Paris, lakini Wuhan. Tuna ushahidi kwamba Peter Daszak alikuwa tayari kupunguza pembe za usalama wa viumbe ili kupunguza gharama na kufanya kazi hatari zaidi iliyopendekezwa katika DEFUSE, hasa aina ya kazi ambayo inaweza kuzalisha SARS-CoV-2, katika maabara ya Wuhan ya BSL-2.

Tabia mbaya za upatanishi kati ya ruzuku mnamo 2018 na genome isiyo ya asili, isiyo na kifani ya virusi mnamo 2019 ni karibu sifuri chini ya asili asilia. Kazi yangu juu ya ruzuku ya DARPA PREEMPT ilikuwa kutabiri mabadiliko ya virusi, kwa hivyo naweza kusema kwa ujasiri wa utaalam wangu kwamba jiografia, ugonjwa wa magonjwa, sera ya afya ya umma, na hitilafu za kijiolojia za SARS-CoV-2 sio vile ungetarajia. kutoka kwa mageuzi ya asili ya virusi vya zoonotic. Uunganisho kati ya DEFUSE na SARS-CoV-2 karibu hauwezekani kwa ujuzi wetu wa 2018 wa virusi vya wanyamapori na mabadiliko ya virusi vya wanyamapori, isipokuwa DEFUSE ilitumiwa kama mpango, barua ya dhamira ya kutengeneza riwaya maalum ya kibaolojia ambayo tulipata baadaye. katika mji huo ambapo waandishi hawa walipendekeza kuifanya.

DEFUSE ilikataliwa kwa busara na DARPA, na hii imekuwa hoja ya kawaida. Hata hivyo, DEFUSE PI Daszak ilikuwa na vyanzo vingine vingi vya ufadhili, ikiwa ni pamoja na makumi ya mamilioni ya dola kutoka kwa mpango wa PREDICT wa USAID, Gates Foundation na Mradi wa Global Virome unaofadhiliwa na Wellcome Trust wa CEPI, na hata NIAID.

Kwa hakika, NIAID haikufadhili Daszak tu kupitia ruzuku ya "Kuelewa hatari ya kuibuka kwa coronavirus ya popo," lakini ruzuku hii ya NIAID pia ilipanuliwa na kujumuisha PI zote za DEFUSE mnamo 2019. Barua pepe iliyo hapa chini kuanzia Oktoba 2019 ina wachezaji msingi wa DEFUSE. ambao hawakuwa wamewahi kushirikiana na kuandika hati kwa pamoja kabla ya DEFUSE wala kushirikiana tangu (ouihaagendazs ni Ben Hu wa Taasisi ya Wuhan ya Virology na gnyny0803 ni Li Guo). Waandishi wanaruka kwenye "simu ya NIAID SARs-CoV" mnamo Jumatano, Oktoba 30, wakipendekeza DEFUSE PI's ambao bidhaa yao pekee ya utafiti inayojulikana ni DEFUSE walikuwa wakishirikiana kikamilifu kupitia NIAID wakati wa kuibuka kwa SARS-CoV-2.

Ushahidi wa Kufunika

Taasisi ya Wuhan ya Virology ilikuwa na hifadhidata ya mamia ya genomes za sarbecovirus na jeni spike, lakini hifadhidata hiyo ilifutwa mnamo Septemba 2019. Serikali ya Uchina iliamuru kuharibiwa kwa kesi na mlolongo wa mapema, na mifuatano iliyofutwa kutoka kwa seva za NCBI imepatikana na Jesse Bloom, kuangazia zaidi mlipuko wa mapema, na kutatiza hadithi ya mageuzi na janga la soko la Chakula cha Baharini la Huanan (ni uwezekano gani kwamba mlolongo uliofutwa unathibitisha hadithi ya soko la mvua dhidi ya kuifanya ngumu?).

Serikali ya Uchina ilitenga vipimo vya PCR kwa wagonjwa wa Wuhan walio na viunganisho kwenye soko la mvua au wasafiri wanaokuja kutoka Wuhan na kuunganishwa na kesi zinazojulikana huko Wuhan, na Wuhan pekee ndiye aliyefungiwa, sera ambayo haina maana chini ya SARS-CoV-1. kitangulizi cha mlipuko wa biashara ya wanyama ulioenea kijiografia katika SARS-CoV-1. Kwa kweli, kwa kuwa SARS-CoV-1 kulikuwa na uvujaji wa maabara 6 wa SARS-CoV-1 nchini Uchina, na hiyo inaweza kuwa kielelezo kinachoongoza sera ya afya ya umma ya China.

Peter Daszak, kiongozi wa DEFUSE, hakufichua DEFUSE kama mgongano wa kimaslahi alipochaguliwa kuwa mjumbe wa Merika kwa uchunguzi wa asili ya Covid wa WHO huko Wuhan, na hakufichua DEFUSE alipochaguliwa kuongoza Lancet Uchunguzi wa asili ya Covid.

Daszak alienda mbali zaidi. Alishirikiana na DEFUSE wenzake Ralph Baric na Linfa Wang kuandika makala kwa Lancet kuziita nadharia za asili ya maabara "nadharia za njama." Sio tu kwamba Daszak hakufichua DEFUSE kama COI, lakini barua pepe hiyo pia inaonyesha nia ya Daszak ya kuandika makala, kuficha migongano ya maslahi, yote kwa madhumuni ya kuvuruga Lancet hadhira kutoka kwa jukumu kuu la DEFUSE PIs linalofanya kazi na maabara katika kiini cha nadharia ya asili ya maabara kuunda riwaya ya kibaolojia inayolingana na vipimo vya SARS-CoV-2. Ikiwa kiumbe kilichoelezewa katika DEFUSE kilikuwa na hati miliki, SARS-CoV-2 itakuwa ukiukaji wa hataza yao.

Mada ya barua pepe ya Daszak inasomeka:

"Hakuna haja ya wewe kusaini 'Taarifa' Ralph!!"

Daszak na Linfa Wang walikubaliana kwamba yeye, Wang, na Baric hawapaswi kusaini taarifa waliyoandika na wanapanga. "Kwa hivyo iko umbali fulani kutoka kwetu na kwa hivyo haifanyi kazi kwa njia isiyo na tija." Baric akajibu, "Pia nadhani huu ni uamuzi mzuri. Vinginevyo inaonekana kujitumikia na tunapoteza athari.

Hapa chini, pia tunayo barua pepe ambayo Daszak aliwaandikia wenzake wa mpango wa PREDICT wa USAID mwezi Aprili 2020 na mada.

RE: Utaratibu wa China Genbank
Umuhimu: Juu

Yote - Ni muhimu sana kwamba hatuna mfuatano huu kama sehemu ya toleo letu la PREDICT kwa Genbank kwa wakati huu.

Kama umesikia, hizi zilikuwa sehemu ya ruzuku iliyokatishwa hivi punde na NIH.

… Kuwa nao kama sehemu ya PREDICT itakuwa [sic] tahadhari isiyofaa sana kwa UC Davis, PREDICT na USAID.

Hongera, Peter

Ruzuku iliyokatishwa inayozungumziwa ni ruzuku ile ile ya NIAID iliyoleta washirika wa DEFUSE pamoja mwaka wa 2019. Je, Taratibu hizi za China Genbank za umuhimu wa juu zilikuwa zipi? Kwa nini mfuatano huu uliounganishwa na ruzuku ya NIAID ya DEFUSE PI ungeleta uangalizi usiofaa?

Ikiwa mlolongo huu ulikuwa mlolongo wa asili wa sarbecovirus na ikiwa SARS-CoV-2 walikuwa sarbecovirus ya asili ya popo, basi Utaratibu wa China Genbank ungeimarisha historia ya mabadiliko ya sarbecoviruses, ikitusaidia kuona wazi zaidi kwamba SARS-CoV-2 ilikuwa virusi vya asili. Ikiwa hivyo ndivyo, wachache wangekuwa na motisha kubwa kuliko Daszak kufichua mfuatano huu, lakini badala yake alichagua kuuzuia.

Ikiwa SARS-CoV-2 ingekuwa bidhaa ya maabara ya kazi inayohusiana na DEFUSE, basi inaeleweka kuwa ruzuku ya NIAID inayounganisha washiriki wa DEFUSE ingekomeshwa na misururu inayohusishwa na ruzuku hii ingeleta "makini isiyokubalika" kwa wale waliochapisha mlolongo, kwa sababu. mtu kama mimi angeangalia mlolongo huo na kugundua kuwa unatoa ushahidi thabiti zaidi kwamba SARS-CoV-2 ilikuwa bidhaa ya kazi inayohusiana na DEFUSE, kwamba washukiwa walikuwa na jenomu kwenye kompyuta zao kabla ya kuibuka kwa virusi hivi.

Ingekuwa na maana kwamba Daszak hatafichua DEFUSE wala Utaratibu wa China Genbank kwa sababu angekuwa na fahamu ya hatia. Ingekuwa na maana angejidai kama mjumbe wa Marekani kwa uchunguzi wa WHO na kiongozi wa shirika hilo Lancet Asili ya Covid hufanya uchunguzi bila kuathiri msimamo wake kwa kufichua migongano yake ya kimaslahi kwa sababu ana hitaji la kutosha la kuhakikisha uchunguzi unakuja kuamini kuwa hii ni virusi vya asili, hata kama sivyo.

Kumebakia uwezekano kwamba Taasisi ya Wuhan ya Virology inaweza kuendelea na kazi inayohusiana na DEFUSE bila idhini ya Peter Daszak. Hata hivyo, hilo linaonekana kutowezekana tunapochunguza jinsi jumuiya ya wanasayansi inavyofanya kazi. Daszak alikuwa kiongozi mkuu wa muungano mkubwa wa kimataifa, EcoHealth Alliance, mwenye uwezo wa kupata makumi ya mamilioni ya dola kutoka kwa mradi wa PREDICT wa USAID, Wellcome Trust na Mradi wa Global Virome unaofadhiliwa na Gates Foundation, ruzuku ya NIAID “Kuelewa hatari ya popo. kuibuka kwa coronavirus," na zaidi.

EcoHealth Alliance ilikuwa nguvu sana hivi kwamba watafiti katika Taasisi ya Wuhan ya Virology hawangeweza kuchapisha kazi kama hiyo bila kujumuisha DEFUSE PI's - jaribio lolote la kuchapisha kazi kama hiyo lingetiwa alama kuwa kushindwa kutoa mikopo kwa DEFUSE PI's na kwamba vita vya ukaguzi wa rika vingekuwa. kashfa ya maadili ya utafiti ambayo inawatenga WIV kutoka kwa wenzao wenye nguvu zaidi na waliounganishwa vyema, ikizuia kwa kiasi kikubwa uwezo wao wa kuwa na athari katika saikolojia ya wanyamapori kwa miaka mingi baadaye.

WIV ilichapisha mifumo ya awali ya reverse genetics (Peng et al 2016) na CoV za chimeric (Hu et al. 2017) akiwa na Daszak. Alikuwa mshirika wa karibu na wa kuthaminiwa wa timu ya popo sarbecovirus katika WIV, alikuwa karibu zaidi katika mtandao katika WIV kuliko Ralph Baric, na WIV ilikuwa na kila motisha ya kufanya utafiti huu na Daszak ili kuongeza ufikiaji wa kazi yao kupitia yake. mtandao mkubwa wa kimataifa wa wataalam wa virusi vya wanyamapori.

Inawezekana serikali ya Uchina ingeweza kuendelea na kazi hii katika mpangilio ulioainishwa, lakini hilo halingeeleza kukataa kwa Daszak mwenyewe kufichua DEFUSE, "Taarifa" ya Baric haikulazimika kutia saini, Mifuatano ya China Genbank ilizuiwa.

Kufunga hotuba

Karatasi zinazodai asili ya zoonotic zote zimebatilishwa.

Ruzuku ya DEFUSE ilipendekeza mpango mahususi wa utafiti mnamo 2018 ambao ungeunda virusi kama SARS-CoV-2, kutoka kwa tovuti ya furin cleavage ambayo haijawahi kurekodiwa kwenye sarbecovirus hadi ramani ya kizuizi cha BsaI/BsmBI isiyo ya kawaida kati ya CoVs mwitu na inayoendana na kinyume. mfumo wa genetics uliokusanywa na sehemu 6. Wakati pekee BsaI na BsmBI zilitumika kwenye CoV kabla ya Covid ni wakati Ben Hu, Peter Daszak, na Shi Zhengli walipotengeneza sarbecovirus za chimeric huko Wuhan.

Nadharia ya asili ya maabara ilifanya utabiri kadhaa juu ya mbinu maalum za utafiti ambazo zingesababisha kuundwa kwa SARS-CoV-2, na rasimu zilizopatikana hivi karibuni za DEFUSE zina njia hizo kwa maelezo ya kushangaza, kutoka kwa uwekaji wa S1/S2 wa tovuti ya kugawanya furin. kwa mkusanyiko wa sehemu 6 na fomu za agizo za BsmBI. Rasimu za DEFUSE pia zinaonyesha ufahamu wa Daszak juu ya maswala ya usalama wa viumbe ya DoD, na nia yake ya kudanganya DoD katika hatari kubwa kwa ubinadamu kwa kudai kufanya utafiti hatari katika maabara ya UNC ya BSL-3 lakini akikusudia kufanya kazi hiyo katika Taasisi ya Wuhan ya Virology. maabara ya BSL-2 yenye matatizo.

Waandishi wa DEFUSE ni ushirikiano wa kipekee. Hawakuwa wamewahi kuandika karatasi pamoja kabla ya KUKATAA. Wote walikuwa kwenye simu na NIAID wakijadili kuhusu SARs-CoVs mwaka wa 2019. Aliyejumuishwa kwenye simu hiyo ya 2019 alikuwa Ben Hu, mwanasayansi haswa ambaye alikuwa wa kipekee katika kutumia BsaI + BsmBI kwenye coronavirus ya kabla ya Covid. Baada ya SARS-CoV-2 kuibuka, Daszak aliratibu na Baric na Linfa Wang kuandika "Taarifa" lakini sio kutia saini ili kutoonekana kujihudumia, na Daszak aliandika barua pepe ya umuhimu wa juu akiwaamuru wenzake wa UC Davis wasipakie China Genbank. Mfuatano ambao ulikuwa sehemu ya ruzuku ya NIH/NIAID iliyokatishwa hivi majuzi inayounganisha DEFUSE PI's.

Ushahidi tulionao unapendekeza sio tu bila shaka yoyote kwamba SARS-CoV-2 iliibuka kutoka kwa maabara, lakini kwamba ushirikiano wa kipekee unaotuongoza kuamini asili ya maabara bila shaka yoyote ilikuwa na msaada wa NIAID, ulikuwa na mlolongo ambao walizuia kwa maarifa ambayo mlolongo unaweza kuleta. usikivu usiokaribishwa kwa yeyote aliyezipakia, na akaendelea kuweka kile ambacho kihalali kinaweza kuitwa kampeni ya upotoshaji inayoita nadharia za asili ya maabara "nadharia za njama" huku wakifanya njama za kutosaini taarifa zao wenyewe ili kuwapotosha wasomaji kufikiria kuwa taarifa kama hizo zilitoka kwa wanasayansi huru, wasio na migogoro.

Zaidi ya watu milioni 20 wamekufa. Zaidi ya watu milioni 60 walikabiliwa na njaa kali. Zaidi ya watoto milioni 100 walitupwa katika umaskini wa pande nyingi. Mabilioni ya dola yalipotea kutokana na janga la Covid-19. Janga la Covid-19 lilikuwa janga la kihistoria ambalo lilitokana na watafiti ambao walikuwa na DEFUSE mkononi na ambao kwa hiari walipita sheria na kanuni za kufanya kazi hatari ambayo waandishi walijua ingeongeza pathogen inayoweza kuwa ya janga, kwani madhumuni ya PREEMPT ilikuwa kuzuia milipuko kwa kuzingatia. juu ya uwezekano wa magonjwa ya janga.

Waandishi walioandika DEFUSE walikuwa na fahamu ya hatia mara tu bidhaa ya utafiti iliyopendekezwa katika ruzuku yao ilipoanza kuzunguka ulimwenguni kote, na wanasayansi wetu na taasisi za ufadhili wa sayansi zimeficha habari muhimu inayofichua asili ya utafiti uliopendekezwa, na kufanywa, saa. Taasisi ya Wuhan ya Virology kwa msaada wa walipa kodi wa Merika.

Muda, uchanganuzi wa kitaalamu wa jenomu ya SARS-CoV-2, na ushahidi zaidi umeimarisha tu kesi ya asili ya maabara. Tunaweza kuimarisha kesi zaidi kwa ushahidi zaidi, lakini kwa habari katika kikoa cha umma tayari tuna ushahidi wa kutosha kuhalalisha sababu zinazowezekana za kuchunguza DEFUSE PI, uthibitisho wa ushahidi katika kesi za madai za DEFUSE PI, na imani isiyo na shaka-bila shaka kwamba SAR. -CoV-2 iliibuka kutoka kwa maabara hata ikiwa hatujui ni nani aliyeshikilia bomba. Nitawaruhusu wanasheria watambue ikiwa kukwepa ulinzi wa usalama wa viumbe hai na kuua kwa bahati mbaya watu milioni 20 ni uzembe, ikiwa kusababisha janga la kimataifa ni uhalifu.

Kesi ya kisayansi ya kisayansi ya asili ya SARS-CoV-2 ni kama kesi ya mtandao wa karibu wa marafiki ambao wote walikuwa kwenye chumba ambacho mtu alikufa, tuna pendekezo la marafiki hawa kumuua mtu huyo maalum kwa risasi maalum, katika chumba hicho maalum, wakati huo wa jumla wakati watafiti hawa wote walikuwa kwenye chumba pamoja. Ingawa taarifa hiyo haikufadhiliwa, inapaswa kusomwa kama ufunuo wa nia ya kikundi. Huenda hatujui nani alifyatua risasi, lakini tunajua mauaji yalitokea na kila mwandishi wa barua hiyo ni mshukiwa ambaye anajua zaidi kuliko sasa wanashiriki na umma.

Wakati umepita wa uchunguzi usio na upendeleo ambao unalazimisha uhifadhi wa hati na wahusika wote waliopatikana katika eneo la uhalifu.

Tunaweza kutenganisha tukio hili linalohusiana na utafiti kutoka kwa jamii yetu na kutoka kwa sayansi yote mara tu tunapotenganisha wanasayansi na wafadhili wao na kuwalazimisha kutoa akaunti kamili ya shughuli zao huko Wuhan mnamo 2019. Ni hapo tu ndipo ulimwengu unaweza kuwa na ukweli, upatanisho. , na matumaini ya udhibiti sahihi wa utafiti hatari na mifumo ya kisayansi ambayo ilifanya janga lililoundwa na maabara kuwezekana.

Imechapishwa tena kutoka kwa mwandishi Kijani kidogo